Zasób materiałów archiwalnych jest w dobrym stanie (w formie oprawnej), ale nie jest kompletny, ponieważ - jak wspomniano w monografii Szkoły pt. „Pochodem idziemy ..."". Dzieje i legenda Szkoły im. Stefana Batorego, praca zbiorowa, t. 2, wyd. przez PIW w 1993 r. s. 42 - „Archiwum Szkoły rozgrabiono lub spalono".

W historii Szkoły miały miejsce następujące zmiany organizacyjne: 1 IX 1918 - III 1919 - Królewsko-Polskie Gimnazjum im. Stefana Batorego III 1919 - 1937/38 - Państwowe Gimnazjum im. Stefana Batorego 1938/39 - I Państwowe Liceum i Gimnazjum im. Stefana Batorego 1945 - 1947/48 - Państwowe Gimnazjum i Liceum im. Stefana Batorego 1948/49 - 1950/51 - Szkoła Ogólnokształcąca stopnia licealnego im. Stefana Batorego 1951/52 - 1952/53 - X Ogólnokształcąca Szkoła stopnia licealnego T.P.D. 1953/54 - 1956/57 - X Liceum Ogólnokształcące T.P.D. 1957/58 - 1963/64 - Liceum Ogólnokształcące Nr 2 im. Stefana Batorego 1964/65 - 2013/14- II Liceum Ogólnokształcące im. Stefana Batorego II Liceum Ogólnokształcące im. Stefana Batorego w Warszawie od roku szkolnego 2005/06 realizuje program Międzynarodowej Matury (International Baccalaurente).