1. Wydział Ogólny (164 j.a.): instrukcje, zarządzenia, okólniki, organizacja administracji skarbowej, struktura wewnętrzna Izby, urzędnicy, budżety, sprawozdania z działalności, referat dyscyplinarny (normatywy, sprawy indywidualne), ewidencja akt przechowywanych i udostępnianych 2. Wydział Podatków Bezpośrednich (135 j.a.) 2.1. Oddział Administracyjny: statystyka podatkowa, kontakty z podległymi urzędami w sprawach podatków 2.2. Oddział Podatku Dochodowego: wymiar podatków - arkusze, pobór podatku przemysłowego, wykazy firm, zwroty i umorzenia 2.3. Oddział Podatków Realnych: okólniki, wykazy podatków od kapitałów i rent 2.4. Oddział Podatku Obrotowego: akta dotyczące firmy L. Baerwald 2.5. Oddział Bilansowy: przywóz i wywóz towarów, cło, kontrola skarbowa na granicy polsko-gdańskiej 2.6. Oddział Egzekucyjny: analizy czynności egzekucyjnych, postępowanie egzekucyjne, kontrola skarbowa na granicy polsko-gdańskiej 2.7. Oddział Katastralny: statystyka roczna, sprawozdania z lustracji 3. Wydział Rachunkowo-Kasowy (63 j.a.) 3.1. Oddział Administracyjny - okólniki, instrukcje kasowe, przepisy rachunkowe, dozór walutowy, depozyty, rekwizycje, protokoły rewizji kas skarbowych 3.2. Oddział Sum Niebudżetowych - sumy obrotowe, zabezpieczenia kredytowe 4. Wydział Akcyz i Monopolów (127 j.a.) 4.1. Oddział Administracyjny: lustracje urzędów akcyz 4.2. Oddział Akcyzowo-Monopolowy: dozór, statystyka, kontrola, postępowanie przekazowe, ulgi podatkowe, kredyty, sprawy karne 4.3. Oddział Karno-Skarbowy: okólniki, sprawy karne 5. Wydział Opłat Stemplowych (9 j.a.) 5.1. Oddział Opłat: instrukcje, okólniki dotyczące opłat 5.2. Oddział Podatku Spadkowego: indeksy, dotacje

W 1920 r. administrację podatków pośrednich oraz opłat stemplowych i spadkowych przekazano czasowo Dyrekcji Ceł w Poznaniu. Administracją podatków bezpośrednich zajmował się Urząd Wojewódzki Pomorski w Toruniu. 1 VII 1920 r. rozpoczęła działalność Pomorska Dyrekcja Ceł w Grudziądzu. 1 X 1920 r. została przekształcona w Pomorską Izbę Skarbową w Grudziądzu, która przejęła także sprawy podatków bezpośrednich z urzędu wojewódzkiego. Na czele izby stał prezes. Izbie w Grudziądzu w 1924 r. podlegało 18 urzędów skarbowych. Organami władz skarbowych, wyodrębnionymi z administracji skarbowej pierwszej instancji, były rejony kontroli skarbowej. W 1935 r. powołano powiatowe i wojewódzkie komisje klasyfikacyjne. Powiatowe komisje klasyfikacyjne utworzono w siedzibie urzędu skarbowego. Na podstawie przeprowadzonej klasyfikacji zostały założone powiatowe rejestry gruntów. Izba nadzorowała podległe jej urzędy skarbowe i organy wykonawcze, prowadziła czynności związane z wykonaniem budżetu państwa, orzekała w pierwszej instancji w sprawach niezastrzeżonych dla ministra skarbu oraz jako organ odwoławczy w sprawach należących do kompetencji podległych jej urzędów. Pobieranie podatków pośrednich (konsumpcyjny i monopolowy), podatków pośrednich (gruntowy, budynkowy, procederowy, dochodowy, uzupełniający, od przyrostu majątku, od kapitałów i rent, od skrzynek depozytowych, domokrążnego, obrotowego i od przyrostu wartości majątku) i opłat skarbowych - spadkowego i stemplowego należało do zadań urzędów skarbowych. Klasyfikacja gruntów na obszarze całego kraju miała na celu ustalenie jednolitych podstaw dla równomiernego wymiaru podatku gruntowego i utrzymania ewidencji gruntów. Izba Skarbowa w Grudziądzu funkcjonowała na terenie województwa pomorskiego.