Oddział Ogólny (1867–1916): sprawy organizacji Zarządu, dzienniki kancelaryjne, okólniki i korespondencja dotyczące m.in. epidemii cholery, aptek, spraw medycznych i weterynaryjnych, spraw kultu religijnego, emerytur, kultury i szkolnictwa, organizacja szkolnictwa na terenie powiatu, wybory administracji gminnej (wójtów, sołtysów, sędziów i ławników gminnych), wykazy stowarzyszeń i organizacji oraz ich statuty, akta dotyczące działalności przedstawicieli władz miejskich i powiatowych, protokoły posiedzeń Zarządy Powiatowego (1910, 1913–1914), materiały dotyczące podziału gruntów, stanu zaludnienia, produkcji roślinnej i zwierzęcej, liczby majątków ziemskich i gospodarstw chłopskich, liczby warsztatów rzemieślniczych, sklepów, składów i magazynów, akta osobowe pracowników Zarządu i magistratów miejskich Pułtuska i Nasielska, sprawy wydawania paszportów i dowodów tożsamości, akta kontroli Zarządu, magistratów miejskich i urzędów gminnych (sygn. 1–191). Oddział Ekonomiczno-Administracyjny (1870–1916): korespondencja w sprawach podatkowych i wymiaru kar, akta dotyczące gospodarki finansowej miast i gmin powiatu, korespondencja i okólniki w sprawach finansowo-administracyjnych, m.in. korespondencja dotycząca opracowania planu regulacyjnego Nasielska (1876–1912), akta budowy fortu w Pułtusku (1891–1901), akta wywłaszczeń gruntów (1892–1913) pod budowę szos strategicznych Pułtusk–Wyszków i Nieporęt–Beniaminów oraz nadnarwiańskiej linii kolejowej, melioracja bagien, dane o władzach cechów rzemieślniczych oraz o rzemieślnikach w powiecie, akta dotyczące oświetlenia Nasielska, remontów budynków, budowy kościołów, działalności mariawitów, utrzymania i budowy dróg (sygn. 192–579). Oddział Wojskowo-Policyjny (1880–1917): okólniki i korespondencja dotyczące zakwaterowania i zaopatrzenia wojska oraz postępowania z ludnością cygańską, żydowską i więźniami, zarządzenia i pozwolenia (m.in. określające zasady ruchu rowerów i pojazdów mechanicznych w Pułtusku, działalności kin, posiadania broni), konfiskata nielegalnej broni, sprawy akt stanu cywilnego i meldunkowych, nadzór nad działalnością Straży Ziemskiej, akta dotyczące działalności towarzystw, organizacji społecznych i związków religijnych, akta osób znajdujących się pod nadzorem policji, korespondencja w sprawach duchowieństwa rzymskokatolickiego i organizacji uroczystości kościelnych, karty mobilizacyjne (1914–1915), dokumentacja strat poniesionych w czasie działań wojennych (1915), nadzór nad szkołami, w tym akta dotyczące strajku szkolnego w Pułtusku (1905) (sygn. 580–864). Akta Sekwestratora Powiatowego (1896–1915): akta dotyczące egzekucji należności, w tym korespondencja, protokoły, wykazy, rejestry podręczne, arkusze podatkowe, dzienniki wyjazdów, dzienniki kancelaryjne, katalog książek biblioteki Zarządu (sygn. 865–911).

W latach 60 -tych XIX wieku przystąpiono w Rosji do przeprowadzenia szeregu reform, które przypadły na okres, kiedy w Królestwie Polskim po upadku powstania styczniowego carat przyspieszył proces ograniczenia i likwidacji urzędów i instytucji autonomicznych. Rozbudowano wówczas aparat administracyjny rosyjski w celu opanowania kraju. W 1866 roku powiększono ilość guberni z pięciu do dziesięciu, tworząc następujące gubernie: warszawską, radomską, kaliską, piotrkowską, kielecką, lubelską, siedlecką, płocką, łomżyńską i suwalską. Gubernie dzieliły się na powiaty. Na mocy postanowienia Komitetu Urządzającego Królestwa Polskiego z dnia 29.XII.1867 utworzono powiat pułtuski z guberni łomżyńskiej w skład którego weszły następujące jednostki organizacyjne: miasta - Pułtusk, Nasielsk, Serock i Wyszków oraz gminy wiejskie: Kozłowo, Kleszewo, Obryte, Lubiel, Leszczydół, Somianka, Zatory, Gzowo, Winnica, Gołębie, Czajki, Nasielsk i Zegrze. Zarząd Guberni stanowili: gubernator, wicegubernator i zarząd gubernialny. 13 stycznia 1867 r. weszła w życie ustawa o "Zarzadzie gubernialnym i powiatowym w guberniach Królestwa". Zgodnie z wymienioną ustawą na czele powiatu stał naczelnik powiatu, który miał dwóch zastępców: jednego do wykonania czynności administracyjnych, drugiego do czynności policyjnych. Pomocnik naczelnika powiatu do czynności policyjnych był jednocześnie naczelnikiem Straży Ziemskiej bezpośrednio mu podległej. Naczelnik powiatu część swych kompetencji wykonywał osobiście, a część we współdziałaniu z podległym mu kolegium. Kolegialnemu załatwianiu w zarządzie powiatowym podlegały następujące sprawy: przyjmowanie od cudzoziemców przysięgi na wierność poddaństwa, zażalenia osób prywatnych na bezprawną działalność urzędników, zatwierdzanie kosztorysów na budowy i remonty w miastach, udzielanie zezwoleń na wydawanie materiałów budowlanych, decyzje w sprawach rozbiórki zdewastowanych budynków, wymierzanie kar administracyjnych, pociąganie do odpowiedzialności prawnej winnych przekroczenia przepisów policji lekarsko-weterynaryjnej, budowlanej, ogniowej i ogólnej. Przy zarządzie powiatowym powołano "biuro" składające się z oddziałów, referatów i innych stanowisk według etatu. Organizacja Biura Zarządu Powiatowego wyglądała następująco: I/ Oddział Ogólny; II/ Oddział Ekonomiczno-Administracyjny; III/ Oddział Wojskowo-Policyjny. Do zakresu działania Oddziału Ogólnego należało ogłaszanie zarządzeń, odwoływanie, zwalnianie i pociąganie do odpowiedzialności urzędników, wydawanie decyzji w sprawach zmiany granic powiatów, przygotowanie sprawozdań rocznych i opracowań statystycznych oraz załatwianie wszelkich spraw związanych z zarządem gminnym. W zakres czynności Oddziału Ekonomiczno-Administracyjnego wchodziły sprawy dotyczące administracji i gospodarki powiatu, a więc: przemysł, handel, rzemiosło, zarząd miast i wymiar kar z tytułu administracji lasami oraz sprawy ubezpieczeniowe, skarbowe i.t.p. Kompetencji Oddziału Wojskowo-Policyjnego podlegały następujące sprawy: dostarczanie wojsku podwód i kwater, udzielenie pomocy materialnej dymisjonowanym wojskowym i ich rodzinom, prowadzenie ksiąg ludności, zarząd więzieniami i aresztami, sprawy lekarsko-policyjne, celne i graniczne. Ponadto pomocnikowi do czynności administracyjnych podlegał nadzór nad prawidłowym prowadzeniem kancelarii urzędu i archiwum. Zarządy Powiatowe na terenie Królestwa Polskiego funkcjonował do 1915 r. tj. do chwili ewakuacji administracji rosyjskiej w głąb Rosji w związku z działaniami wojennymi.