Gabinet Ministra: schematy organizacyjne, zarządzenia, protokóły posiedzeń kolegium, plany, sprawozdania, Biuletyny Ministerstwa Kolei, 1945-1957, sygn. 1-175, 473-475, 482-501; Departament Zagraniczny; rokowania, umowy, rozliczenia, 1946-1957, sygn. 176-212; Departament Planowania: plany, sprawozdania, analizy, 1951-1956, sygn. 213-244; Departament Organizacji, Zatrudnienia i Płac (Departament Zatrudnienia i Płac, Biuro Socjalne): zarządzenia, zestawienia, sprawozdania, 1951-1955, sygn. 245-256, 364-366, 368; Departament Organizacji: schematy organizacyjne, protokóły, 1950-1957, sygn. 257-346; Departament Szkolenia Zawodowego: plany, sprawozdania, zestawienia, 1952-1955, sygn. 347-363; Departament Zdrowia, 1954, 1955, sygn. 367; Departament Finansowy (Księgowości), 1951-1956, sygn. 369-377; Departament Zaopatrzenia, 1951, 1953, sygn. 378-380; Departament Inwestycji, 1952, 1953, 1955, sygn. 381-388; Departament Techniki, 1956, sygn. 389; Departament Budżetowo-Gospodarczy, 1950-1956, sygn. 390-413, 502-549; Departament Ruchu (Główny Inspektor Bezpieczeństwa Ruchu), 1950-1953, 1956, sygn. 422-429, 454-458; Departament Handlowo-Taryfowy, 1951-1956, sygn. 430-442; Departament Mechaniczny, 1949-1954, sygn. 443-446; Departament Drogowy, 1954, sygn. 447; Departament Kolei Dojazdowych, 1951-1953, sygn. 448-452; Biuro Turystyki, 1950-1952, 1954, sygn. 414-421; Komenda Główna Służby Ochrony Kolei, 1955, 1956, sygn. 453; Biuro Zarządu ds. Umów Międzynarodowych Krajów Socjalistycznych, 1951, 1955, 1956, sygn. 459-465; Polsko –Czechosłowacka Komisja Komunikacyjna, 1951, sygn. 455-468; Polsko-Węgierska Podkomisja Komunikacyjna, 1950, 1951, sygn. 469-472; Departament Organizacyjno-Prawny: zarządzenia Ministra, umowy międzynarodowe, [1945-1950] 1951-1957, sygn. 476-481.

Ministerstwo Kolei powstało na mocy ustawy z dnia 26 lutego 1951 r. Zakres działania Ministerstwa obejmował: naczelny zarząd przedsiębiorstwa Polskie Koleje Państwowe oraz kierowanie działalnością przedsiębiorstw produkcyjnych, budowlanych, projektowych, handlowo-usługowych; wydawanie dla podległych przedsiębiorstw normatywów technicznych i technologicznych; opracowywanie dokumentacji technicznej w zakresie budownictwa kolejowego; ustalanie typów konstrukcji budowli, taboru, urządzeń kolejowych, łączności i sygnalizacji; wydawanie przepisów; organizacja i nadzór nad ochroną porządku na kolejach użytku publicznego; wydawanie taryf dla przewozu osób, bagażu, towarów; wydawanie przepisów przewozu kolejami poczty, transportów wojskowych i organów bezpieczeństwa publicznego; organizowanie badań naukowych, nadzór podległych instytutów naukowo-badawczych. Ministerstwo Kolei zakończyło swoją działalność z dniem 5 kwietnia 1957 r. Na nocy tej ustawy urzędy: Ministra Kolei oraz Ministra Transportu Drogowego i Lotniczego zostały połączone w urząd Ministra Komunikacji.