Gabinet Prezesa: protokóły, sprawozdania, 1957, 1960-1969, sygn. 1/1-51; Biuro Wodno-Prawne: zarządzenia, 1961, 1962, sygn. 1/52-54; Departament Organizacyjno-Prawny: Wydział Prezydialny - protokóły, plany, 1963-1972, sygn. 1/65-78; Wydział Organizacji –sprawozdania, 1960-1972, sygn. 1/79-88; Wydział Administracji Terenowej -konferencje, kontrole, 1960-1971, sygn. 1/89-113); Wydział Prawny –zarządzenia, 1961,1962,1965-1971, sygn. 1/114-138; Wydział Orzecznictwa -opinie, decyzje, 1963-1965, 1967-1969, sygn. 1/139-143); Sekretariat - zarządzenia, sprawozdania, 1958, 1962-1964, 1967, 1968, sygn. 1/144-151; Wydział Planowania –plany, 1961, 1963-1969, sygn. 1/152-157); Wydział Uzgodnień i Dokumentacji -sprawozdania, dokumentacja [1921-1956] 1957-1967, sygn. 1/158-177); Wydział Współpracy z Zagranicą -sprawozdania [1948-1956] 1957-1967, sygn. 1/178-258; Wydział Zasobów i Rozrządu Wód -1969, sygn. 1/259; Biuro Katastru Wodnego -1965, sygn. 1/260; Zespół Rzeczoznawców Gospodarki Wodnej -analizy, projekty 1957, 1958, 1960-1970, sygn. 1/261-325; Departament Techniki: Sekretariat-plany, sprawozdania, 1959-1971, sygn. 1/326-332, 1/394-410; Wydział Rozwoju Nauki i Techniki -plany, analizy 1960-1962, sygn. 1/333-345; Wydział Normalizacji i Typizacji –plany, 1958-1971, sygn. 1/346-393; Departament Inwestycji: Wydział Planowania Inwestycji -analizy, plany, sprawozdania, 1960-1971, sygn. 1/411-449; Wydział Dokumentacji -analizy 1961-1965, 1967, 1968, sygn. 1/450-458; Główny Geolog -mapy, instrukcje, 1960-1962, 1964, sygn. 1/459-470; Departament Ekonomiczno –Finansowy: bilanse, analizy kosztów, 1960-1971, sygn. 1/471-540; Biuro Kadr i Szkolenia Zawodowego, 1960-1972, sygn. 1/606-664. Centralne Biuro Studiów i Projektów Budownictwa „Hydroprojekt”: plany, projek-ty,1963-1967, sygn. 1/541-560; Przedsiębiorstwo Geologiczno-Inżynierskie Budownictwa Wodnego „Hydrogeo”: plany,1963-1967, sygn. 1/561-580; Biuro Projektów Typowych Oczyszczalni Ścieków Przemysłowych Gliwice „Biprotosp”: plany, projekty, 1964, 1965, sygn. 1/581-586; Centralny Zarząd Wód Śródlądowych plany roczne, projekty, 1960-1968, sygn. 1/587-605; Państwowa Inspekcja Ochrony Wód: plany, sprawozdania, protokóły, 1958-1972, sygn. 1/606-976; Instytut Gospodarki Wodnej: plany, 1963, 1964, sygn. 1/976-985.

Ustawą nr 163 Prezesa Rady Ministrów z dnia 1 lipca 1960 r. (Dz.U. Nr 29 z dnia 22 VI 1960 r.) powołany został Centralny Urząd Gospodarki Wodnej. Urząd był organem administracji państwowej w zakresie gospodarki morskiej i podlegał Prezesowi Rady Ministrów Zakres działania obejmował: wykonywanie uprawnień w prawie wodnym naczelnym organom administracji państwowej, uznawanie w porozumieniu z Ministerstwem Żeglugi wód śródlądowych za żeglowne i spławne, ewidencjonowanie i bilansowanie wszelkich zasobów wód, ewidencjonowanie projektów przepisów o projektowaniu, budowie i utrzymaniu oraz eksploatacji wszelkich zakładów, budowli i urządzeń wodnych, mających istotny wpływ na gospodarkę wodną nadzór i kontrola w zakresie ochrony wód przed zanieczyszczeniem, opracowywanie planów gospodarki wodnej, realizację inwestycji, sprawy zabudowy i utrzymania rzek żeglownych spławnych, potoków górskich i sztucznych dróg wodnych, współpracę z zagranicą, ochronę przeciwpowodziową obsługę hydrologiczną i metrologiczną kraju. Sprawował nadzór nad organami gospodarki wodnej byłych prezydiów rad narodowych. Urząd został zlikwidowany ustawą nr 79 Prezesa Rady Ministrów z dnia 29 marca 1972 r., a jego agendy przejęły odpowiednio Ministerstwa: Administracji, Gospodarki Terenowej i Ochrony Środowiska, Rolnictwa i Żeglugi.