Gabinet Ministra: protokóły posiedzeń kolegium, zarządzenia, sprawozdania, materiały pokontrolne, skargi i zażalenia, 1960-1974, sygn. 1/1-217, 2/1-45, 3/1-74, 60/1-12; Departament Ekonomiczny: zarządzenia, biuletyny statystyczne, 1960-1969, sygn. 4/1-5; Departament Zatrudnienia i Płac: schematy organizacyjne, zarządzenia, plany, sprawozdania, analizy, 1960-1972, sygn. 5/1-157, 6/1-31; Prawno-Administracyjny (Prawny): żegluga morska i śródlądowa, międzynarodowe organizacje ds. bezpieczeństwa żeglugi, prawo morskie, administracja wybrzeża morskiego – protokóły posiedzeń, narad i z sesji Międzynarodowej Organizacji Morskiej (IMCO) i Komisji Transportowej RWPG, teksty konwencji i zarządzeń, referaty, plany, sprawozdania, materiały pokontrolne, 1960-1974, sygn. 7/1-11, 8/1-8, 9/1-10, 10/1-47, 11/1-21, 12/1-6, 13/1-6, 14/1-53, 55/1-53, 56/1-61; Departament Kadr i Spraw Socjalnych: ustawy, instrukcje, plany, sprawozdania, projekty budowy szkól, skargi, 1960-1973, sygn. 15/1-6, 16/1-32, 17/1-72, 18/1-8, 19/1-4; Departament Finansowo – Księgowy: protokóły posiedzeń, plany, bilanse, sprawozdania finansowe, protokóły z kontroli, 1960-1974, sygn. 20/1-221; Departament Inwestycyjno-Techniczny: budowa i zakup statków, budowa i remonty portów – plany, sprawozdania, analizy, opisy i dokumentacja inwestycji, protokóły posiedzeń, opracowania, opinie i ekspertyzy, 1960-1974, sygn. 21/1-191, 22/1-16, 23/1-46, 24/1-18, 25/1-15, 26/1-80, 27/1-204, 54/1-21, 57/1-75; Departament Ekonomiczny i Współpracy Gospodarczej z Zagranicą: protokóły z posiedzeń IMCO i Komisji Transportowej RWPG, zarządzenia, plany, sprawozdania, 1959-1973, sygn. 28/1-24, 29/1-194, 51/1-32; Departament Techniki (Inwestycji) i Eksportu: budowa i remonty portów polskich, budowa i eksploatacja statków w Polsce, zakupy statków za granicą – protokóły posiedzeń analizy, sprawozdania, referaty, opracowania, ekspertyzy, 1956-1972, sygn. 58/1-5, 59/1-31; Departament Polityki Morskiej i Współpracy z Zagranicą: protokóły z posiedzeń IMCO, instrukcje, biuletyny, 1967-1972, sygn. 52/1-40; Departament Zagraniczny: protokóły z posiedzeń IMCO i RWPG, 1971-1974, sygn. 53/1-45; Departament Ekonomiki i Planowania: plany, analizy, protokóły posiedzeń, taryfy, 1965-1972, sygn. 30/1-27, 31/1-11; Departament Polityki Gospodarczej: protokóły posiedzeń, programy, opracowania, 1970-1973, sygn. 32/1-11; Departament Prawny: zarządzenia, sprawozdania, 1972-1974, sygn. 33/1-5; Departament Żeglugi Morskiej: działalność Polskich Linii Oceanicznych, Polskiej Żeglugi Morskiej, polskich przedstawicielstw, spółek z mieszanym kapitałem, tranzyt morski , likwidacja Gdynia Ameryka Linie – statuty, protokóły posiedzeń komisji, w tym Komisji Transportowej RWPG, sprawozdania, zarządzenia , analizy, instrukcje, zestawienia, bilanse, 1951-1966, sygn. 34/1-29, 35/1-61, 36/17, 37/1-47, 38/1-24; Departament Polityki Morskiej i Współpracy z Zagranicą: spółki z kapitałem polskim, przedstawicielstwa polskie za granicą, umowy międzynarodowe w sprawie żeglugi i tranzytu, eksploatacja polskich statków: protokóły z posiedzeń, w tym Komisji Transportowej RWPG, plany, sprawozdania, zarządzenia, 1955-1972, sygn. 39/1-6, 40/1-88, 41/1-93, 42/1-125, 44/1-33; Departament Portów: plany, sprawozdania, 1961-1965, sygn. 45/1-3; Biuro Gospodarcze: plany, 1970, 1971, sygn. 46/1, 2; Departament Zaopatrzenia i Zbytu: plany, sprawozdania, zestawienia, 1960-1971, sygn. 47/1-6, 48/1-32; Departament Wojskowy: plany, preliminarze, zestawienia, 1964-1967, sygn. 49/1-12; Archiwum: spisy zdawczo-odbiorcze akt, 1949-1971, sygn. 50/1-7.