- Kancelaria prezydialna (KP), 1867 – 1913, 38 j.a. (zarządzenia i okólniki władz zwierzchnich, protokoły posiedzeń RGS) - Wydział administracyjny (WA), 1867 – 1912 [1913-1917], 519 j.a. (podania ubiegających się o przyjęcie do pracy, akta osobowe pracowników rządu i podległych mu urzędów, zażalenia na postępowanie urzędników, korespondencja w sprawach wyznaniowych, zezwolenia na remont i budowę domów, kościołów , cerkwi, kaplic, synagog i na urządzenie cmentarzy, plany tych obiektów oraz miasta Białej i części Kodnia) - Wydział budowlany (WB), 1872 – 1913, 57 j.a. (akta dotyczące budowy i remontu domów w miastach guberni siedleckiej, plany, i projekty domów oraz osad: Janowa, Wohynia, Łaskarzewa, miast Sokołowa i Włodawy) - Wydział wojenno – policyjny (WWP), [1861-1866] 1867 – 1912 [1913-1917], 724 j.a. (zarządzenia i okólniki, listy osób poszukiwanych, sprawozdania dotyczące więziennictwa, raporty o więźniach, rozliczenia z przyznanych kredytów, instrukcje o prowadzeniu ksiąg ludności, korespondencja w sprawach finansowych, akta dotyczące lazaretów wojskowych, zaopatrzenia armii w opał, furaż, i produkty spożywcze, materiały związane z przyjęciem poddaństwa rosyjskiego przez cudzoziemców zamieszkałych w guberni siedleckiej) - Wydział prawny (WP), 1867 – 1912 [1913-1914], 101 j.a. (sprawy finansowe, podatkowe, nakładania kar na osoby uchylające się od służby wojskowej, zbierania dobrowolnych ofiar na różne cele) - Wydział lekarski (WL), 1872 – 1912 [1913-1918], 1280 j.a. (prośby w sprawie otwarcia aptek i składów aptecznych, udzielania zezwoleń felczerom, na prowadzenie praktyki zawodowej, korespondencja dotycząca głównie farmaceutów i ruchu służbowego pracowników wydziału, dane statystyczne o zmarłych na terenie guberni w latach 1910-1913) - Kasa pożyczkowo – oszczędnościowa (KPO), 1892 – 1912 [1913-1914], 16 j.a. (fragmentaryczne dokumenty finansowe) - Redakcja „Siedleckich Wiadomości Gubernialnych” (SV), 1904 – 1905, 2 j.a. (korespondencja w sprawie honorariów autorskich) - Siedlecki Gubernialny Komitet Pomocy Powodzianom, 1884 – 1886, 10 j.a. (wykazy osób i wysokości składanych przez nich ofiar w gotówce na rzecz poszkodowanych przez wylew Wisły)

Rząd Gubernialny Siedlecki powołany został na mocy „Ustawy o zarządzie gubernialnym i powiatowym w guberniach Królestwa Polskiego” z 19/31 grudnia 1866 r. (Dziennik Praw Królestwa Polskiego, t. 66, s. 119). Ustanowiony nowy podział administracyjny Królestwa Polskiego, wprowadził zamiast dotychczasowych 5, 10 guberni, w tej liczbie siedlecką z siedzibą w Siedlcach. W skład guberni siedleckiej wchodziło 9 powiatów: siedlecki, bialski, węgrowski, garwoliński, konstantynowski, radzyński, sokołowski i łukowski. Ustawa z dnia 23 czerwca 1912 r. o nowym podziale administracyjnym Królestwa Polskiego likwidowała gubernię siedlecką, tym samym zakończona została działalność Rządu Gubernialnego Siedleckiego. Poszczególne powiaty zlikwidowanej guberni siedleckiej włączono do nowoutworzonej guberni chełmskiej - bialski, konstantynowski, włodawski; guberni lubelskiej - garwoliński, łukowski, radzyński, siedlecki, sokołowski; guberni łomżyńskiej – garwoliński. Zarząd gubernią powierzony został gubernatorowi i podlegającemu mu Rządowi Gubernialnemu jako organowi władzy wykonawczej na terenie guberni. Do kompetencji Rządu Gubernialnego należał całokształt spraw związanych z administrowaniem i bezpieczeństwem guberni, w tym m.in. sprawy wyznaniowe, więziennictwa, finansowe, podatkowe, służby zdrowia, przyjmowania poddaństwa rosyjskiego, służby wojskowej, zaopatrzenia armii, funkcjonowania lazaretów wojskowych, prowadzenia ewidencji ludności, nadzór nad ruchem budowlanym itp. Rząd Gubernialny Siedlecki dzielił się na 5 wydziałów: Administracyjny, Budowlany, Wojenno – Policyjny, Prawny, Lekarski oraz Kancelarię Prezydialną przy której istniała redakcja „Siedleckich Wiadomości Gubernialnych”. Wydziały dzieliły się na referaty na czele ze starszymi i młodszymi referentami. Kancelaria Prezydialna, której zarząd sprawował sekretarz i wydziały znajdowały się pod ogólnym zwierzchnictwem wicegubernatora. Rząd Gubernialny rozpatrywał kolegialnie sprawy na posiedzeniach pod przewodnictwem gubernatora lub wicegubernatora z udziałem 4 radców wydziałów. W 1897 r. sprawy służby weterynaryjnej będące w gestii Wydziału Lekarskiego przeniesiono do nowopowstałego Wydziału Weterynaryjnego.