Biuro Ministra: ustalenia z posiedzeń Kierownictwa, materiały na posiedzenia Kierownictwa, raporty posiedzeń Zespołu ds. Koordynacji Realizacji "Planu działań zmierzających do redukcji cen usług telekomunikacyjnych w tym kosztów dostępu do Internetu", wewnętrzne regulaminy organizacyjne, decyzje, zarządzenia Ministra, sprawozdania z działalności; współpraca z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów, Min. Spraw Zagranicznych, mediami - protokoły posiedzeń Zespołu Negocjacyjnego, umowy wielostronne; struktury stowarzyszeniowe RP-UE, fundusze; współpraca z administracją centralną i terenową z instytucjami międzynarodowymi - notatki, korespondencja, sprawozdania z wyjazdów zagranicznych; nabywanie i zbywanie nieruchomości, programy inwestycyjne, strategia rozwoju, wycinki prasowe, [1997-2000] 2001-2005, sygn. 1/1-65, 19/1-3, 41/1-57, 51/1-195; Departament Lotnictwa: Komisje/zespoły międzyresortowe - wnioski, opinie, korespondencja; skargi i wnioski, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, interwencje posłów i senatorów; współpraca z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów, ministerstwami, urzędami centralnymi, Unią Europejską, Europejską Konfederacją Lotnictwa Cywilnego; nadzór nad jednostkami podległymi, ochrona lotnictwa cywilnego, lotnicze przejścia graniczne, 2001-2005, sygn. 2/1-27, 30/1-3; Krajowa Rada Bezpieczeństwa Ruchu Drogowego: konferencje, narady, spotkania, plany, sprawozdania, skargi, wnioski, prace naukowo-badawcze, wystawy, prezentacje, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, interwencje posłów i senatorów, współpraca z ministerstwami i urzędami centralnymi, współpraca międzynarodowa, plany i programy poprawy stanu bezpieczeństwa ruchu drogowego, programy rządowe, sprawozdania, 2002-2005 [2006], sygn. 3/1-61; Departament Transportu Drogowego: rozporządzenia, zgody, zarządzenia Ministra, skargi i wnioski, prace naukowo-badawcze, współpraca z Sejmem i Senatem, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, interwencje posłów i senatorów, współpraca z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów, ministerstwami i urzędami centralnymi, administracją terenową, umowy międzynarodowe, zezwolenia, zgody, warunki przewozu towarów niebezpiecznych, nadzór nad Generalną Dyrekcją Dróg Publicznych, 2001-2005, [2006-2007], sygn. 4/1-113, 12/1-24, 25/1-24, 54/1-9, 74/13-14; Departament Budżetu i Analiz Ekonomicznych: decyzje, rozporządzenia Ministra, sprawozdania z działalności, współpraca z Sejmem i Senatem, ministerstwami i urzędami centralnymi, projekty budżetu, kontrole, 2001-2005, sygn. 5/1-353, 32/1-11, 66/1-9; Państwowa Komisja Badania Wypadków Lotniczych: wypadki lotnicze - protokoły, 2002-2005 [2006], sygn. 6/1-207, 47/1-2, 73/1-5; Departament Telekomunikacji: akty normatywne, skargi, wnioski, interpelacje i zapytania poselskie, fundusze przedakcesyjne PHARE, protokół z kontroli, korespondencja, restrukturyzacja zobowiązań koncesyjnych - wnioski, 2001-[2006], sygn. 7/1-50, 13/1-20, 16/1-11, 43/1-17, 59/1-2; Departament Poczty: Komisje/zespoły własne - protokoły posiedzeń, akty normatywne, korespondencja dotycząca zmiany przepisów, skargi i wnioski, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, współpraca z komisjami sejmowymi i senackimi, opracowania, negocjacje akcesyjne, współpraca z UE, współpraca z międzynarodowymi organizacjami pocztowymi, kontrole, wnioski, zbiory znaczków i kart pocztowych wprowadzonych do emisji, [1988-2000] 2001-2005, sygn. 8/1-75, 14/1-8, 42/1-7, 60/1-4; Departament Kolejnictwa: projekty ustawy, decyzje Ministra, interpelacje, zapytania i interwencje poselskie, Fundusze przedakcyjne PHARE 2001 - programy restrukturyzacji kolei polskich, nadzór właścicielski, [1996-2000] 2001-2005, sygn. 9/1-202, 18/1-50, 50/1-42, 53/1-3, 74/12; Departament Współpracy z Zagranicą i Spraw Europejskich: umowy wielostronne i dwustronne, programy przygotowania do członkostwa Polski w EU, udział w posiedzeniach komisji, grup roboczych w kraju i zagranicą, sprawozdania z rozmów, sprawozdania, instrukcje z wyjazdów służbowych, 2001-2005, sygn. 10/1-275, 68/1-35, 74/199-200; Departament Transportu Morskiego: decyzje, postanowienia Ministra, analiza skarg i wniosków, współpraca z ministerstwami, współpraca z zagranicą, realizacja uprawnień udziałowca/akcjonariusza w spółkach z udziałem zagranicznym - protokoły posiedzeń, 2001-2005, sygn. 11/1-8, 21/1-15, 56/1-3; Biuro Dyrektora Generalnego: protokoły, sprawozdania z narad pracowniczych, upoważnienia i pełnomocnictwa, akty normatywne, plany i programy, wyjaśnienia przepisów, ewidencja skarg i wniosków, wnioski o mianowanie profesorów, analizy wypadków i chorób zawodowych, kontrole, 2001-2005, sygn. 15/1-62, 74/1-4; Gabinet Polityczny: współpraca z Sejmem, ministerstwami, partiami politycznymi, związkami zawodowymi, współpraca zagraniczna, 2001-2005, sygn. 17/1-20; Resortowa Komisja Orzekająca: naruszenie dyscypliny finansów publicznych- akta spraw, rejestry, 2002-2005, sygn. 20/1-5; Departament Spraw Obronnych: akty normatywne, 2001-2005, sygn. 22/1-10; Departament Planowania Strategicznego i Polityki Transportowej: przejścia graniczne- umowy, porozumienia, budowa i utrzymanie, sprawozdania z kontroli, 2001-2005, sygn. 23/1-34; Departament Finansowania Infrastruktury: współpraca z UE w ramach wykorzystania środków z funduszy przedakcesyjnych, 2002-2004, sygn. 24/1-8; Biuro Administracyjno-Budżetowe: regulaminy, organizacja i działalność Gospodarstwa Pomocniczego - decyzje, bilanse, księgi inwentarzowe, protokoły posiedzeń Komisji BHP, analizy stanu BHP, kontrole, nabywanie i zbywanie nieruchomości, 2001-2005, sygn. 26/1-13, 72/1-21, 74/205; Departament Dróg Publicznych: interpretacja przepisów ustawy, skargi i wnioski, współpraca zagraniczna, finansowanie dróg z rezerwy budżetowej, odstępstwa od warunków techniczno-budowlanych, 2003-2005, sygn. 27/1-60, 55/1-323; Departament Funduszy UE: program PHARE, współpraca z ministerstwami, urzędami centralnymi, samorządem, skargi i wnioski, wnioski o płatność, oceny projektów, opracowania, nadzór nad realizacją inwestycji, przejścia graniczne, [1997-2000] 2001-2003, 2005, sygn. 28/1-17, 44/1-32, 74/15-28; Biuro Audytu: plany, sprawozdania z wykonania planu, korespondencja, 2002-2005, sygn. 29/1-3; Departament Współpracy z Zagranicą: instrukcje, sprawozdania z wyjazdów, udział w posiedzeniach Komisji, grup roboczych w kraju i za granicą, 2004-2005, sygn. 31/1-9, 46/1-5, 74/202-204; Departament Kontroli: plan, analizy skarg i wniosków, protokoły kontroli, wystąpienia pokontrolne, 2001-2005, sygn. 33/1-173, 49/1-15, 69/1; Departament Geodezji i Kartografii: sprawozdania z konferencji, prace naukowo-badawcze, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, interwencje posłów i senatorów, skargi i wnioski, 2002-2006, sygn. 34/1-21; Departament Mieszkalnictwa: akty normatywne, interpelacje przepisów prawnych, prace naukowo-badawcze, korespondencja z ministerstwami i urzędami centralnymi, 2005-2005, sygn. 35/1-12; Departament Orzecznictwa: decyzje Ministra, wyroki NSA, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, współpraca z Kancelarią Prezesa Rady Ministrów oraz komitetami RM - korespondencja, opracowania, postępowanie dotyczące usprawnień zabużańskich, wywłaszczenia i rewindykacja, 2004-2005 [2006-2008], sygn. 36/1-130, 65/1-8; Departament Architektury i Budownictwa: interpretacje przepisów prawnych, skargi i wnioski, odstępstwa od przepisów techniczno-budowlanych - wnioski, upoważnienia, odmowy; analizy, opinie, odpowiedzi na interpelacje i zapytania poselskie, 2001-2005 [2006], sygn. 37/1-97, 62/1-118; Departament Ładu Przestrzennego: konferencje, spotkania, narady - referaty, zaproszenia, rezolucje; interpretacje przepisów prawnych, skargi i wnioski, prace naukowo-badawcze, opracowania problemowe, odpowiedzi na interpelacje posłów i senatorów, współpraca z ministerstwami i urzędami centralnymi, współpraca międzynarodowa, planowanie przestrzenne - odpowiedzi na zapytania, sprawy administracyjne i sądowo-administracyjne, 2003-2005, [2006], sygn. 38/1-78, 61/1-17; Departament Finansowania Mieszkalnictwa: akty normatywne, odpowiedzi na interpelacje posłów i senatorów, protokoły kontroli, sprawozdania z realizacji planów finansowych, kontrole, korespondencja, 2003-2005, sygn. 39/1-22, 63/1-4; Departament Regulacji Rynku Nieruchomości, 2003-2005, sygn. 40/1-83; Departament Administracji Morskiej i Śródlądowej: akty prawne, prace naukowo-badawcze, współpraca z mediami, organizacjami międzynarodowymi w zakresie bezpieczeństwa żeglugi, 2003-2005, sygn. 45/1-14, 57/1-28; Biuro Komunikacji Społecznej: współpraca z mediami, 2003, sygn. 48/1-2; Sekretarz Stanu: polityka regionalna - korespondencja, 2002-2003, sygn. 52/1-2; Departament Programowania i Strategii: współpraca zagranicą - umowy dwustronne; autoryzacja i notyfikacja jednostek oceny zgodności - wnioski, opinie, oceny, decyzje, [1994-2000] 2001-2005 [2006], sygn. 58/1-22, 74/29-39; Departament Prawno-Legislacyjny: Komisje/zespoły własne - protokoły spotkań, korespondencja; upoważnienia, rozporządzenia, decyzje, zarządzenia, komunikaty Ministra, teki wydawnicze - Dziennik Urzędowy Ministra Infrastruktury, współpraca, dostosowywanie polskich przepisów do europejskiego prawa wspólnotowego, [1997-2000] 2001-2005 [2006-2007], sygn. 64/1-825, 74/41-148, 74/207-230; Departament Finansowania Infrastruktury i Funduszy Europejskich: współpraca z Bankiem Światowym - korespondencja, plany, fundusze przedakcyjne, Fundusz Spójności, 2004-2005, sygn. 67/1, 74/149-197; Biuro Kadr: protokoły przekazania dokumentacji Ministerstwa Rozwoju Regionalnego i Budownictwa, odznaczenia państwowe - wnioski, korespondencja, postanowienia Prezydenta RP, 2001-2005, sygn. 70/1-11; Biuro Ochrony Informacji Niejawnych: protokół przekazania dokumentacji finansowej, osobowej oraz spraw Ministerstwa Rozwoju Regionalnego i Budownictwa, 2001, sygn. 71/1; Departament Rozwoju Transportu: finansowanie inwestycji - zestawienie zadań, sprawozdania, rozliczenia; plany inwestycyjne, 2002-2003, sygn. 74/5-11; Departament Strategii Rozwoju Infrastruktury: decyzja, 2003, sygn. 74/40; Departament Integracji Europejskiej i Współpracy z Zagranicą: sygn. 74/198; Biuro Informatyki: sygn. 74/201; Gospodarstwo Pomocnicze: sygn. 74/206

Ministerstwo Infrastruktury powołane zostało 23 października 2001 r. na podstawie rozporządzenia Rady Ministrów z dnia 20.10.2001 r. (Dz.U., Nr 122, poz. 1326). Ministerstwo zostało utworzone w drodze przekształcenia Ministerstwa Transportu i Gospodarki Morskiej. Ministerstwo obsługiwało działy administracji rządowej: transport, gospodarka morska, łączność, budownictwo, gospodarka przestrzenna i mieszkaniowa. Rozporządzeniem Rady Ministrów z dnia 31 października 2005 r. (Dz.U., Nr 220, poz. 1884) Ministerstwo Infrastruktury zostało przekształcone w Ministerstwo Transportu i Budownictwa.

sygn. 74/1-230 poddane fumigacji w 2021 r.