I. Akta prezydialne 1. Struktura organizacyjna (1-a, 1-b, 2-bsygn 1-8, 2. Kontrole i wizytacje (4-a, 4-b)sygn. 9-15, 3. Konferencje, narady, odprawy (4-c, 4-d)sygn. 16-17, 4. Sprawozdawczość opisowa i statystyczna (5, 5-b)sygn. 18-46, 5. Współpraca z sądem (6-a)sygn. 47, 6. Dziennik spraw prezydialnychsygn. 48, II. Akta osobowe pracownikówsygn. 49-138, III. Pomoce kancelaryjne 1. Repertor sygn. 139-235, 2. Skorowid sygn. 236-270, 3. Wyka sygn. 271-274, 4. Rejestry, księgi, kartoki sygn. 275-286, IV. Akta spraw prokuratorskich 1. „S” - śledztw własnychsygn. 287-290, 2. „Sm” - śledztw prowadzonych za pośrednictem Milicji sygn. 291-308, 3. „s” - spraw karny sygn. 309-312, 4. „W” - nadzoru nad wykonaniem wyroksygn. 313-325

Sukcesywnie przejmowany od 1944 roku leninowski model prokuratury został w Polsce wprowadzony w życie na mocy ustawy z dnia 20 lipca 1950 r. o Prokuraturze RP (Dz. U. nr 38, poz. 346). Prokuratura stała się wówczas odrębnym organem państwowym, wydzielonym ze struktury sądów powszechnych i Ministerstwa Sprawiedliwości, powołanym nie tylko do ścigania przestępstw i sprawowania nadzoru nad wykonaniem kary, ale także do sprawowania nadzoru ogólnego nad przestrzeganiem prawa oraz występowania w procesach cywilnych. Podporządkowana Radzie Państwa, organizacyjnie odpowiadała podziałowi administracyjnemu kraju składając się z: Prokuratury Generalnej, prokuratur wojewódzkich i prokuratur powiatowych. Prokuratura Miasta i Powiatu Włocławskiego we Włocławku powołana została 1 września 1950 r. „w miejsce” zlikwidowanej Prokuratury Sądu Okręgowego we Włocławku. Prokuratura przez cały dwudziestopięcioletni okres działalności hierarchicznie podlegała Prokuraturze Wojewódzkiej w Bydgoszczy i Prokuraturze Generalnej w Warszawie. Zgodnie ze statutem obejmowała jednocześnie miasto Włocławek (Rejon I) i powiat włocławski (Rejon II). Na początku 1959 r. doszło do zmiany nazwy jednostki, przemianowanej na Prokuraturę Powiatową we Włocławku. W 1966 r. nastąpiła istotna modyfikacja struktury wewnętrznej prokuratury, kiedy zlikwidowano podział terytorialny na powiat i miasto, a wprowadzono kryterium rzeczowo-specjalistyczne: Rejon I – Dochodzeniowy i Rejon II - Śledczo-Specjalistyczny. Z dniem 1 stycznia 1969 r. przywrócono podział Prokuratury Powiatowej we Włocławku na Rejon I dla spraw, w których przestępstwa popełnione zostały na terenie miasta Włocławka oraz Rejon II, dla spraw w których przestępstwa popełnione zostały na terenie powiatu włocławskiego Była to już ostatnia zmiana struktury organizacyjnej, aczkolwiek w celu usprawnienia pracy w 1974 r. powołano jeszcze zespół do prowadzenia śledztw i spraw wydzielonych. Prokuratura Powiatowa we Włocławku została zlikwidowana z dniem 1 czerwca 1975 r. W jej miejsce utworzono Prokuraturę Rejonową we Włocławku, podlegającą nowo powołanej Prokuraturze Wojewódzkiej we Włocławku.