Dział I Ogólny: sprawy domu królewskiego, recesy wizytacyjne, cyrkularze i zarządzenia Kolegium Wymiaru Sprawiedliwości, protokoły i postanowienia synodu prowincjonalnego, zarządzenia ogólne konsystorza i generalnego superintendenta w sprawach kościelnych, 1730-1896 sygn. 1-6. Dział II: akta zarządu gminy kościelnej: renty dla wdów po pastorach, powołanie przewodniczącego zarządu gminy, wybór reprezentacji parafii, fragmenty kroniki miejskiej, sprawozdania o świętach kościelnych, artykuły prasowe przedstawiające dzieje gminy kościelnej oraz spis parafian. Księgi kościelne: świadectwa chrztów i konfirmacji, rejestry konfirmantów, 1716-1920 sygn. 7-16. Dział III: rachunki kasy kościelnej 1672-1831, reces separacyjny miasta Mikołajki, 1832-1833 sygn. 17-23. Registratura szkolna: akta wizytacji szkoły w Prawdowie, 1822-1858 sygn. 24.

Parafia ewangelicka w Mikołajkach powstała po sekularyzacji Państwa Krzyżackiego w 1525 r. Bezpośredni dowód na istnienie kościoła w Mikołajkach, pochodzi z 1529 r. Jest to reces wizytacji parafii sporządzony przez pastora z Kętrzyna. O istnieniu kościoła w Mikołajkach świadczy także wiadomość, iż na początku XVIII w. pastor Andreas Kowalewski zakupił 2 dzwony dla świątyni oraz przeprowadził malowanie jej wnętrza. W poszycie dziewiątym zespołu (sygn. 1331/9) znajduje się niepełny wykaz pastorów i diakonów od 1550 do 1809 r. oraz informacje statystyczne i artykuły prasowe o mieście i parafii mikołajskiej. W 1912 r. parafia liczyła 4980 wiernych, w tym co najmniej 1500 Mazurów. Na jej terenie działało 15 szkół.